MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 7206

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017167	TAG	2	6	2343462	2343467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_017167	ATA	2	6	2343484	2343489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_017167	CA	3	6	2343500	2343505	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5504	NC_017167	AAAC	2	8	2343548	2343555	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5505	NC_017167	AGA	2	6	2343558	2343563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_017167	AT	3	6	2343570	2343575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_017167	TTC	2	6	2343631	2343636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_017167	CCG	2	6	2343964	2343969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5509	NC_017167	ATC	3	9	2344065	2344073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_017167	CAA	2	6	2344082	2344087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_017167	CTT	2	6	2344133	2344138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_017167	GCT	2	6	2345187	2345192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_017167	CAT	2	6	2345300	2345305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_017167	GTC	2	6	2345403	2345408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_017167	AT	3	6	2347416	2347421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_017167	TTC	2	6	2347518	2347523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_017167	TCG	2	6	2347537	2347542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_017167	CAT	2	6	2347623	2347628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_017167	CGG	2	6	2347664	2347669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_017167	CAT	3	9	2347679	2347687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5523	NC_017167	AAC	2	6	2347810	2347815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_017167	TTGGCC	2	12	2347823	2347834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_017167	CCT	2	6	2349362	2349367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5533	NC_017167	GCCA	2	8	2350635	2350642	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5534	NC_017167	TCTT	2	8	2351190	2351197	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5545	NC_017167	CA	3	6	2353064	2353069	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5601	NC_017167	AGCCT	2	10	2368564	2368573	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5602	NC_017167	CCG	2	6	2368720	2368725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5603	NC_017167	GCGCA	2	10	2368730	2368739	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5604	NC_017167	ACA	2	6	2368753	2368758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5611	NC_017167	CGT	2	6	2368956	2368961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5621	NC_017167	GC	3	6	2370501	2370506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5622	NC_017167	GC	3	6	2370510	2370515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5623	NC_017167	CGG	2	6	2370592	2370597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5629	NC_017167	TGT	2	6	2371484	2371489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5631	NC_017167	GGCCA	2	10	2371597	2371606	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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5997	NC_017167	CG	3	6	2555124	2555129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5998	NC_017167	CCGCC	3	15	2555137	2555151	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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